Det finns sex appellationer i Jura, som alla måste buteljeras i respektive produktionsområde:

AOC Côtes du Jura
AOC Arbois
AOC L'Étoile
AOC Château Chalon: Detta är det främsta Vin Jaune i Frankrike och också en egen appellation. Knappt 40 hektar vingårdar ger denna ovanliga nektar som bara framställs extra bra år (1974, 1980 och 1984 framställdes till exempel inget Château Chalon).
AOC Crémant de Jura
AOC Macvin du Jura: Ett rött, vitt eller roséfärgat starkvin som görs på druvmust och eau-de-vie de Marc från Franche-Comté.

VDQS Bugey (450 hektar)
Ligger söder om Jura. Där odlas traditionella druvsorter för framställning av rött, rosé- och vitt vin, men också mousserande och pétillant med Appellation Vin du Bugey och Rousette du Bugey följt av namnet på växtplatsen.